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ChIP-seq染色质图谱检测方法的局限性及改善方式

2023-03-29
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ChIP-seq是最广泛使用的染色质图谱检测方法,但有很大的局限性,具体表现为:

ChIP-seq染色质图谱检测方法的局限性及改善方式

1.高细胞需求量;

2.低吞吐量;

3.技术困难;

4.高成本,深度测序;

5.数据质量差,变量大


CUT&RUN和CUT&Tag检测法正在取代ChIP-seq

简化的工作流程跳过了ChIP-seq实验法中的挑战性步骤,包括染色质片段化和抗体pull down,用更少的细胞和测序读数得到更佳的数据。

ChIP-seq染色质图谱检测方法的局限性及改善方式

具体变现为:

1.低细胞需求量;

2.高吞吐量;

3.操作流程更简易;

4.低成本,测序读取次数更少;

5.数据质量可靠,重复性好



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