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RIG-I 信号通路

2023-06-13
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RIG-I 配体

• 5’ppp-dsRNA

5’ppp-dsRNA 是一种5’三磷酸双链RNA,通过一个由19个核酸分子通过磷酸二酯键聚合成的5`三磷酸单链RNA和其非三磷酸互补链杂交形成。5’ppp-dsRNA的序列可以通过筛选各种序列突变体确定。未加帽的5’三磷酸双链RNA能够被RIG-I特异性识别。

• 3p-hpRNA

3p-hpRNA是通过体外转录甲型流感病毒(H1N1)序列而产生的5’三磷酸发夹RNA。这个有87个核酸分子的RNA寡核苷酸含有未加帽的5`三磷酸酯末端和双链片段,它们是RIG-I识别的特征结构。3p-hpRNA是RIG-I的一种有效并特异性的激动剂。


RIG-I/MAVS 报告基因细胞

InvivoGen提供一系基于人源肺癌细胞株A549,小鼠巨噬细胞RAW和人源胚肾细胞HEK293稳转细胞系,助力RNA感受器RIG-I信号通路的研究。这些细胞系包括RIG-I或MAVS基因的敲除细胞株(衍生自A549或RAW细胞系)或者RIG-I基因的过表达细胞株(衍生自HEK-293细胞系)。

• A549-Dual™

• A549-Dual™ KO-RIG-I

• A549-Dual™ KO-MAVS    

• RAW-Lucia™ ISG

• RAW-Lucia™ ISG KO-RIG-I

• RAW-Lucia™ ISG KO-MAVS

• HEK-Lucia™ Null

• HEK-Lucia™ RIG-I



描述


所有的RIG-I/MAVS报告基因细胞系均表达一个含有分泌型荧光素酶基因ISG(干扰素刺激基因)诱导型构件。活化RIG-I/MAVS信号通路可诱导ISG启动子的活化并产生荧光素酶,该酶存在于细胞上清并能够通过荧光素酶检测试剂QUANTI-Luc™检测定量。源于A549的细胞携带一个额外的NF-κB诱导表达分泌型碱性磷酸酶(SEAP)基因构件,该酶的活性能够通过SEAP检测试剂QUANTI-Blue™检测定量。

这些RIG-I/MAVS报告基因细胞株携带Zeocin™单抗性基因或Zeocin™和Blasticidin(参见最后一页)双抗性基因。


结果


使 用 RIG-I激动剂,复合了 LyoVec™的 5’ppp-dsRNA和3p-hpRNA刺激A549-Dual™和RAW-Lucia™ ISG细胞系,ISG应答显著。在A549-Dual™细胞中3p-hpRNA激动性强度明显高于5’pppdsRNA,30 ng/ml的3p-hpRNA复合物活化信号已明显高于300 ng/ml 5’ppp-dsRNA的复合物。相反,在RIG-I-KO或MAVS-KO细胞株中应答消失。使用RIG-I配体刺激HEK-Lucia™对照细胞时ISG反应很弱。而在HEK-Lucia™ RIG-I细胞中,由于RIG-I基因的组成型过表达导致这种应答尤为强烈。同样,当使用3p-hpRNA和5’ppp-dsRNA时观察到更高水平的ISG应答。在衍生自A549的细胞株中NF-κB对于RIG-I配体的反应跟ISG应答是相似的,虽然前者更弱一些(参考网站数据)。

RIG-I 信号通路


ISG对RIG-I配体的反应:使用300 ng/ml的5’ppp-dsRNA或30 ng/ml的3p-hpRNA刺激衍生自A549的细胞;使用1 μg/ml 5’ppp-dsRNA或3p-hpRNA刺激衍生自RAW和HEK293的细胞。经过孵育过夜,可使用QUANTI-Luc™检测上清中Lucia荧光素酶活性的相对光单位(RLUs)以测试ISG的反应。


Product
QuantityCat.code
A549-Dual™ cells3-7 x 10^6 cellsa549d-nfis
A549-Dual™ KO-MAVS cells3-7 x 10^6 cellsa549d-komavs
A549-Dual™ KO-RIG-I cells3-7 x 10^6 cellsa549d-korigi
RAW-Lucia™ISG cells3-7 x 10^6 cellsrawl-isg
RAW-Lucia™ISG-KO-MAVS cells3-7 x 10^6 cellsrawl-komavs
RAW-Lucia™ISG-KO-RIG-I cells3-7 x 10^6 cellsrawl-korigi
HEK-Lucia™ Null cells3-7 x 10^6 cellshkl-null
HEK-Lucia™ RIG-I cells3-7 x 10^6 cellshkl-hrigi
5’ppp-dsRNA25 µgtlrl-3prna
3p-hpRNA25 µgtlrl-hprna


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PRODUCTDESCRIPTIONCAT. CODE
QUANTI-Luc™Luciferase detection reagentrep-qlc1
QUANTI-Blue™SEAP detection reagentrep-qb1



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