植物基因组DNA的提取通常采用机械研磨的方法，由于植物细胞匀浆含有多种酶类(尤其是氧化酶类)对DNA的抽提产生不利的影响，在抽提缓冲液中需加入抗氧化剂或强还原剂(如巯基乙醇)以降低这些酶类的活性。在液氮中研磨，材料易于破碎，并可减少研磨过程中各种酶类的作用。

    十二烷基肌酸钠(sarkosyl)、十六烷基三甲基溴化铵(hexadyltrimethyl ammomum bromide，简称为CTAB)、十二烷基硫酸钠(sodium dodecyl sulfate，简称SDS)等离子型表面活性剂，能溶解细胞膜和核膜蛋白，使核蛋白解聚，从而使DNA得以游离出来。再加入苯酚和氯仿等有机溶剂，能使蛋白质变性，并使抽提液分相，因核酸(DNA、RNA)水溶性很强，经离心后即可从抽提液中除去细胞碎片和大部分蛋白质。上清液中加入无水乙醇使DNA沉淀，沉淀DNA溶于TE溶液中，即得植物总DNA溶液。

一.CTAB法
CTAB(十六烷基三乙基溴化铵)是一种去污剂，可溶解细胞膜，它能与核酸形成复合物，在高盐溶液中（（0.7 mol/L NaCl）是可溶的，当降低溶液盐浓度到一定程度（0.3 mol/L NaCl）时，从溶液中沉淀，通过离心就可将CTAB-核酸的复合物与蛋白，多糖类物质分开。最后通过乙醇或异丙醇沉淀DNA，而CTAB溶于乙醇或异丙醇而除去。

1.试剂准备
(1)2×CTAB抽提缓冲溶液:
100 mmol/L Tris-HCl （pH8.0），20 mmol/L EDTA-Na2，1.4mol/LNaCl，2% CTAB，使用前加入0.1%（V/V）的β-巯基乙醇。
(2)TE 缓冲液：10mmol/L Tris-HCl, 1mM EDTA（ pH8.0）。
(3)DNase-free RNase A: 溶解RNase A 于TE 缓冲液中，浓度为10mg/mL，煮沸10～  30min, 除去DNase 活性，-20℃贮存。
(4)氯仿-异戊醇混合液（24:1，V/V）：240mL 氯仿（A.R.）加10mL 异戊醇（A.R.）混匀。
(5)3mol/L 乙酸钠（NaAc，pH6.8）：称取NaAc•3H2O 81.62g，用蒸馏水溶解，配制成200mL，用HAc 调pH 至6.5。

2.实验步骤
(1)在2mL离心管中，加入500μl的2×CTAB和20 μl β-巯基乙醇, 65℃预热。
(2)称取新鲜叶片1-2g，用蒸馏水冲洗干净，再用无菌ddH2O冲洗2次，放入经液氮预冷的研钵中，加入液氮研磨至粉末状，用干净的灭菌不锈钢勺转移粉末到预热的离心管中，总体积达到1mL混匀后置65℃水浴中保温45-60min，并不时轻轻转动试管。
注：冻存材料直接研磨，绝对不能化冻。而且粉末应在化冻前转移否则内源性Dnase有可能降解基因组DNA。
(3)加入1/10体积的3mol/L的乙酸钠充分混匀，在冰浴中放置30 min中，4°C 12000 rpm离心5 min，吸上清。
注意，对于幼嫩叶片此步可以省略。对成熟的老叶片需采用。
(4)加等体积的氯仿/异戊醇（24：1），轻轻地颠倒混匀，室温下12 000rpm离心10 min。
(5)移上清至另一新管中，用氯仿/异戊醇重复抽提一次。
(6)移上清至另一新管中，向管中加入1/10体积的RNase A溶液，置37℃ 20-30min。
(7)氯仿/异戊醇抽提后，加入2倍体积的100%乙醇或0.7倍体积异丙醇，会出现絮状沉淀，-20℃放置30 min，12 000rpm离心10-15min回收DNA沉淀。
(8)用70%乙醇清洗沉淀两次，吹干后溶于适量的灭菌TE缓冲液中。
(9)0.8%琼脂糖凝胶电泳检测基因组DNA的完整性。用紫外分光光度计测定DNA浓度。

二.SDS法
SDS法的基本原理是研磨的组织细胞用热的SDS裂解后，加入高浓度的KAc，0℃放置以除去蛋白和多糖类杂质，最后用乙醇或异丙醇沉淀。

1.试剂准备
(1)提取缓冲液
    Tris-HCl        100mmol/L（pH8.0）
    EDTA            50mmol/L （pH8.0）
    NaCl            500 mmol/L
  灭菌后加β-巯基乙醇至10 mmol/L
(2)裂解液20%SDS
(3)高盐溶液5mol/L KAc
(4)RNaseA 10mg/ml

2.实验步骤
(1)取幼嫩的组织材料1-2g,用蒸馏水冲洗干净，再用灭菌ddH2O冲洗2次，放入经液氮预冷的研钵中，加入液氮研磨至粉末状，用干净的灭菌不锈钢勺转移粉末到加有500μL提取液的离心管中,轻轻混匀。
(2)向管中加入50μL 20%SDS溶液，混匀，不可过于强烈震荡以防基因组DNA断裂 ，65℃保温10min，并不时摇动。
(3)加入150μL 5mol/L KAc，混匀，置冰上20-30 min。
(4)4℃,15 000rpm离心15min,转移上清到另一离心管中，加入0.7倍体积的异丙醇，混匀，-20℃沉淀30 min 。
(5)12 000rpm离心10min回收基因组DNA沉淀，吹干后加入适量的灭菌ddH2O或TE溶解DNA。
(6)加入1/10体积的RNaseA，37℃保温20min，除去RNA。
(7)氯仿抽提后，加2倍体积乙醇，-20℃沉淀30 min 。12 000rpm离心10min回收基因组DNA沉淀。
(8)用400μL 70%乙醇洗两次后，吹干，加入适量的灭菌ddH2O或TE溶解DNA。
(9)琼脂糖凝胶电泳检测完整性。用紫外分光光度计测定DNA浓度。